- Dirección General
- Secretaria Particular
- Dirección de Apropiación Social
- Dirección Técnica y de Planeación
- Dirección de Fomento al Posgrado y a la Investigación
- Dirección Innovación y Vinculación con el Sector Productivo
- Dirección Juridica
- Dirección Planetario YOOK' OL KAAB
- Dirección Planetario KA'YOK
- Dirección Planetario CHA'AN KA'AN
- Dirección Planetario SAYAB
